Caudate-putamen och nucleus accumbens i de basala ganglierna (eller egentliga striatum) innehåller GABAergiska projektionsneuroner, som hos gnagare utgör cirka 90 % av alla neuroner i striatum (Gerfen, 1992; 2004; Medina, 2008b; Parent och Hazrati, 1995a; Reiner et al., 1998). Som nämnts ovan tyder data från musen på att de flesta, om inte alla, projektionsneuron i striatum har sitt ursprung i vLGE (Marín et al., 2000; Stenman et al., 2003a). För närvarande kan vi dock inte utesluta möjligheten att vissa neuronala subpopulationer i striatum har sitt ursprung i dLGE (t.ex. vissa lappneuroner , se nedan). Det finns två viktiga undertyper av projektionsneuroner i striatum (fig. 7.7A): hälften av dem innehåller tillsammans GABA och neuropeptiderna substans P/dynorfin (GABA/SP/DYN), medan den andra hälften innehåller tillsammans GABA och neuropeptiden enkefalin (GABA/ENK). Det finns dock några exempel på projektionsneuron som innehåller en kombination av substans P, dynorfin och/eller enkefalin (detta sker mindre ofta i caudate-putamen än i nucleus accumbens, se Gerfen, 2004; Medina, 2008b; Reiner et al., 1998). Dessa två typer av projektionsneuroner skiljer sig åt i fråga om projektioner och funktioner (fig. 7.7B), vilket förklaras i ett separat avsnitt och granskas på andra ställen (Gerfen, 2004; Medina, 2008b; Parent et al., 1995a,b; Reiner et al., 1998; se även kapitlet om de funktionella aspekterna av de basala ganglierna i denna bok). Till exempel projicerar SP-innehållande neuroner i caudate-putamen främst till det inre segmentet av globus pallidus och substantia nigra och är involverade i främjandet av frivilliga rörelser, medan ENK-innehållande neuroner projicerar till det yttre segmentet av globus pallidus och är involverade i blockeringen av ofrivilliga rörelser (fig. 7.7B). Det är inte känt om substans P- eller enkefalininnehållande striatalprojektionsneuroner har sitt ursprung i olika LGE-subdomäner, eller i samma subdomän(er) vid olika tillfällen. Intressant nog regleras differentieringen av dessa två typer av projektionsneuron av olika genetiska kaskader/nätverk, som involverar transkriptionsfaktorn Ebf1 när det gäller SP-innehållande neuroner (Garel et al., 1999; Lobos et al., 2008) och Ikaros-1 när det gäller ENK-innehållande neuroner (Agoton et al., 2007; Martín-Ibañez et al., 2010). Dessa två typer av striatala projektionsneuroner dör vid olika tidpunkter i Huntington’;s sjukdom (ENK-neuroner dör tidigare än SP-neuroner), och detta korrelerar med distinkta motoriska brister i olika stadier av sjukdomen (granskad av Reiner et al., 1998). Studiet av de genetiska regleringsprogrammen som är involverade i differentieringen av dessa två typer av neuroner kan hjälpa till att förstå dessa skillnader.