De oorspronkelijke formule voor Scotchgard werd in 1952 bij toeval ontdekt door 3M-scheikundigen Patsy Sherman en Samuel Smith. De verkoop begon in 1956, en in 1973 kregen de twee chemici patent op de formule.
In 1999 begon het United States Environmental Protection Agency (EPA) een onderzoek naar de klasse chemicaliën die in Scotchgard werd gebruikt, nadat het informatie had ontvangen over de wereldwijde distributie en toxiciteit van perfluoroctaansulfonaat (PFOS), het “hoofdbestanddeel” van Scotchgard. De verbinding perfluoroctaansulfonamide (PFOSA), een precursor van PFOS, was een ingrediënt en is ook omschreven als het “sleutelingrediënt” van Scotchgard. Onder druk van het Amerikaanse EPA heeft 3M in mei 2000 de geleidelijke stopzetting van de productie van PFOA, PFOS en met PFOS verwante producten aangekondigd.
3M heeft Scotchgard opnieuw geformuleerd en vervangt sinds juni 2003 PFOS door perfluorobutaansulfonzuur (PFBS). PFBS heeft een veel kortere halfwaardetijd in mensen dan PFOS (iets meer dan een maand versus 5,4 jaar). In mei 2009 werd PFOS door het Verdrag van Stockholm aangemerkt als een persistente organische verontreinigende stof (POP). In 2018 stemde 3M ermee in om de staat Minnesota $ 850 miljoen te betalen om een rechtszaak van $ 5 miljard te schikken over drinkwater dat was verontreinigd door PFOA en andere fluorosurfactanten.