Het caudatus-putamen en de nucleus accumbens van de basale ganglia (of het eigenlijke striatum) bevatten GABA-erge projectieneuronen, die bij knaagdieren ongeveer 90% van alle neuronen in het striatum vertegenwoordigen (Gerfen, 1992; 2004; Medina, 2008b; Parent en Hazrati, 1995a; Reiner et al., 1998). Zoals hierboven opgemerkt, wijzen gegevens bij de muis erop dat de meeste, zo niet alle, projectie-neuronen van het striatum hun oorsprong vinden in de vLGE (Marín et al., 2000; Stenman et al., 2003a). Niettemin kunnen we op dit moment de mogelijkheid niet uitsluiten dat sommige neuronale subpopulaties van het striatum hun oorsprong hebben in dLGE (bijvoorbeeld sommige patch neuronen , zie hieronder). Er zijn twee belangrijke subtypes van projectie-neuronen in het striatum (Fig. 7.7A): de helft van hen bevat GABA en de neuropeptiden substance P/dynorfine (GABA/SP/DYN), terwijl de andere helft GABA en het neuropeptide enkefaline (GABA/ENK) bevat. Toch zijn er enkele voorbeelden van projectieneuronen die een combinatie van substance P, dynorfine en/of enkefaline bevatten (dit gebeurt minder vaak in het caudateputamen dan in de nucleus accumbens; besproken in Gerfen, 2004; Medina, 2008b; Reiner et al., 1998). Deze twee soorten projectie-neuronen verschillen in hun projecties en functies (Fig. 7.7B), zoals uitgelegd in een aparte paragraaf en elders besproken (Gerfen, 2004; Medina, 2008b; Parent et al., 1995a,b; Reiner et al., 1998; zie ook het hoofdstuk over de functionele aspecten van de Basale Ganglia in dit boek). Zo projecteren SP-bevattende neuronen van het caudateputamen voornamelijk naar het interne segment van de globus pallidus en de substantia nigra en zijn betrokken bij het bevorderen van vrijwillige bewegingen, terwijl ENK-bevattende neuronen naar het externe segment van de globus pallidus projecteren en betrokken zijn bij het blokkeren van onwillekeurige bewegingen (Fig. 7.7B). Het is niet bekend of substance P- of enkefaline-bevattende projectie striatale neuronen hun oorsprong vinden in verschillende LGE subdomeinen, of in hetzelfde subdomein (of dezelfde subdomeinen) op verschillende momenten. Interessant is dat de differentiatie van deze twee typen projectie-neuronen wordt gereguleerd door verschillende genetische cascades/netwerken, waarbij de transcriptiefactor Ebf1 betrokken is in het geval van SP-bevattende neuronen (Garel et al., 1999; Lobos et al., 2008), en Ikaros-1 in het geval van ENK-bevattende neuronen (Agoton et al., 2007; Martín-Ibañez et al., 2010). Deze twee typen striatale projectie-neuronen sterven op verschillende momenten in de ziekte van Huntington (ENK neuronen sterven eerder dan SP neuronen), en dit is gecorreleerd met verschillende motorische stoornissen in verschillende stadia van de ziekte (besproken door Reiner et al., 1998). De studie van de genetische regulatorische programma’s die betrokken zijn bij de differentiatie van deze twee soorten neuronen kan helpen om deze verschillen te begrijpen.