4′,6-Diamidino-2-fenylindool, [DAPI]

Deze pagina geeft een samenvatting van de optische absorptie- en emissiegegevens van 4′,6-Diamidino-2-fenylindool, die beschikbaar zijn in het PhotochemCAD-pakket, versie 2.1a (Du 1998, Dixon 2005). Ik heb hun gegevens bewerkt om deze interactieve grafieken te maken en directe links te geven naar tekstbestanden met de ruwe en bewerkte gegevens. Hoewel ik heb geprobeerd voorzichtig te zijn, kan ik enkele fouten hebben geïntroduceerd; de voorzichtige gebruiker wordt geadviseerd de resultaten te vergelijken met de oorspronkelijke bronnen.

U kunt de grootte van de grafieken wijzigen door te klikken en een rechthoek te verslepen. Als u met de muis over de grafiek gaat, krijgt u een pop-up met de coördinaten. Met een van de icoontjes rechtsboven kunt u de grafiek in andere formaten exporteren.

Absorptie

Deze optische absorptiemeting van 4′,6-Diamidino-2-fenylindool, werd gedaan door R.-C. A. Fuh in de zomer van 1997 met behulp van een Cary 3. De absorptiewaarden werden verzameld met een spectrale bandbreedte van 1,0 nm, een signaalmiddelingstijd van 0,133 sec, een data-interval van 0,25 nm, en een scansnelheid van 112,5 nm/min.

Deze metingen werden geschaald om de molaire extinctiecoëfficiënt te laten overeenkomen met de waarde van 27.000cm-1/M bij 344.0nm (Haugland, 1992).

Original Data |Extinction Data

Fluorescentie

Het fluorescentie-emissiespectrum van 4′,6-diamidino-2-fenylindool, opgelost in water. De excitatiegolflengte was 350nm. De quantumopbrengst van dit molecuul is 0,043 (Härd, 1990). Dit spectrum werd in de zomer van 1997 verzameld met een Spex FluoroMax. De excitatie- en emissiemonochromatoren werden ingesteld op 1 mm, wat een spectrale bandbreedte geeft van 4,25 nm. Het data-interval was 0,5 nm en de integratietijd was 2,0 sec.

De monsters werden geprepareerd in kwartscellen met een padlengte van 1 cm met een extinctie van minder dan 0,1 bij de excitatie- en alle emissiegolflengten om het monster gelijkmatig te belichten en het binnenfiltereffect te vermijden. De donkere tellingen werden afgetrokken en de spectra werden gecorrigeerd voor golflengte-afhankelijke gevoeligheid van het instrument.

Original Data |Emission Data

Notes

We waren niet in staat om een fluorescentiespectrum op te nemen, dus geen bestand is opgenomen.

Dixon, J. M., M. Taniguchi and J. S. Lindsey (2005), “PhotochemCAD 2. A Refined Program with Accompanying Spectral Databases for Photochemical Calculations”, Fotochem. Photobiol., 81, 212-213.

Du, H., R.-C. A. Fuh, J. Li, L. A. Corkan and J. S. Lindsey (1998) PhotochemCAD: A computer-aided design and research tool in photochemistry. Fotochem. Photobiol. 68, 141-142.

Haugland, R. P. (1992-1994) Molecular Probes. Handbook of Fluorescent Probes and Research Chemicals.

HÃÂärd, T., P. Fan and D. R. Kearns (1990) A fluorescence study of the binding of Hoechst 33258 and DAPI to halogenated DNAs. Photochem. Photobiol. 51, 77-86.

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.