Naneštěstí se stále množí i odpadní vody. Z New Yorku a obcí na Long Islandu a v Connecticutu se do Soundu denně přečerpá více než 1 miliarda galonů. Když prší, množství se zvyšuje – a kvalita vody se snižuje -, protože kvůli přetokům jsou městské čistírny odpadních vod nuceny se uzavřít a surové splašky se dostávají do East River, jejíž proudy je rychle odnášejí do Soundu. Dále na východ Sound nadále absorbuje průmyslové odpady, i když v mnohem menší míře než v minulosti.
Ačkoli nikdo nepochybuje o tom, že vypouštění odpadních vod způsobuje škody, úředníci tvrdí, že neexistují komplexní informace o tom, jak pokračující tok odpadních vod ovlivňuje kvalitu vody. Částečně je to proto, že různé státní a místní úřady si jen zřídka sdělují výsledky svých testů. Obce, které obklopují řeku Sound, se neshodnou ani na kritickém aspektu federálního zákona o čistotě vody, který umožňuje Agentuře pro ochranu životního prostředí upustit od požadavků na čištění odpadních vod, pokud obce mohou předložit přesvědčivé argumenty proti čištění. Ve většině případů je nejsnazší cestou k výjimce odvolání se na chudobu. Například město New York uvedlo, že si nemůže dovolit vybudovat „primární“ čistírny, které zákon vyžaduje. (Při primárním čištění se odpadní vody zadržují v nádržích, aby se nečistoty usadily. To ponechává více bakterií než rozsáhlejší a dražší sekundární čištění, které používá několik předměstských jurisdikcí). Kritici tvrdí, že výjimky byly navrženy pro západní státy, kde se pobřežní vody přirozeně čistí v hlubších vodách hned za kontinentálním šelfem. V mělčím prostředí Long Island Sound je situace jiná. „Pokud se pravidla pro čištění zmírní pro jednu elektrárnu, natož pro téměř dva tucty v newyorské metropolitní oblasti, může to mít vážné krátkodobé i dlouhodobé následky,“ řekl nedávno senátor Christopher Dodd z Connecticutu. „Nemá smysl snižovat náklady na čištění jen proto, abychom za to draze zaplatili ztrátou kvality životního prostředí. Očekává se, že Kongres se bude v příštích několika týdnech zabývat prodloužením platnosti zákona o čistotě vody, a úředníci tak možná získají nové zbraně v boji za to, aby se v Soundu dalo opět plavat. Jedno z možných řešení, které navrhl zástupce James J. Howard z New Jersey, vyzývá státy, které sdílejí důležité ústí řeky, k vytvoření společné správní rady. „A to z dobrého důvodu,“ řekla Whitney Tiltová, výkonná ředitelka pracovní skupiny Long Island Sound Task Force. “Když se podíváte na politickou džungli, která se rozprostírá nad Long Island Soundem, zjistíte, že neexistuje jediná jurisdikce s jasným mandátem v oblasti životního prostředí. Jsou zde dva federální úřady E.P.A., dva okrsky Armádního sboru, dva státy, 11 různých okresů a 62 obcí. Connecticut má navíc jeden státní úřad, který testuje kvalitu vody na plážích, a druhý, který ji kontroluje v čistírnách odpadních vod. V New Yorku, kde vodu testují okresní úřady, si úředníci z Long Islandu jen zřídka vyměňují statistiky se svými kolegy na druhé straně Soundu ve Westchesteru. A úředníci na opačných březích si také navzájem vyčítají, že si stanovují různé priority, které se někdy neslučují s kvalitou vody. Dr. Koppelman tvrdí, že Connecticut se „více zajímá o hospodářský rozvoj“ než o znečištění, které může přinést. „To oni podávají žádosti o bagrování přístavů,“ řekl. A město Huntington se obrátilo na soud, aby zabránilo armádním inženýrským sborům v bagrování v Connecticutu, protože se obávalo, že by to mohlo rozvířit těžké kovy a poslat je na jih.
Někteří ekologové lobbují za přísnější limity dusíku a síranů a zákony, které by omezily vypouštění odpadu lodníky – možná místní, nikoli federální zákony, které mohou prosazovat přístavní strážníci. Přinejmenším stejně důležitý by mohl být rozvoj komplexního přístupu k testování vody, plánování a řízení zdrojů. „Mnoho údajů, které jsou již shromážděny, není nikdy využito,“ řekl pan Tilt.
Samy informace samozřejmě změnu nepřinesou. Jedním z důvodů, proč je Hudson méně znečištěný, je to, že existovala soustředěná snaha, aby programy proti znečištění byly úspěšné. Není jasné, zda podobný mandát existuje i na řece Sound.
“Lodníci říkají, že je tam příjemnější plout, ale na jejich trupech roste více škeblí,“ řekl pan Tilt. “To je hezké znamení, že se situace zlepšuje, ale mnoho jachtařů používá protihnilobné barvy, aby se zbavili škeblí, a tím se do vody vracejí vysoce toxické kovy. Je to něco jako Hlava 22.“