V polovině a na konci 60. let byl Kenyatta organizátorem programu Head Start, který poskytoval předškolní vzdělávání a zdravotní služby chudým dětem a jejich rodinám. Podporoval okupaci budovy vlastněné kvakery, kteří požadovali, aby zaplatili odškodné.
Pracoval také pro Mississippi Freedom Democratic Party, skupinu, která zpochybňovala upírání volebního práva Afroameričanům v Mississippi. V této době obdržel dopis, o němž se zjistilo, že byl zfalšován třemi agenty FBI pracujícími v programu COINTELPRO, jehož cílem bylo narušit a zdiskreditovat osoby považované za nebezpečně radikální. Dopis vyhrožoval Kenyattovi varováním, aby se držel dál od Tougaloo College v Mississippi, kde studoval. Z Mississippi odešel, ale později zažaloval vládu za porušení svého ústavního práva na svobodu projevu. Mluvčí univerzity Arthur Page uvedl, že žaloba se nakonec v roce 1985 dostala k soudu v Jacksonu ve státě Mississippi, ale porota nerozhodla v jeho prospěch.
Zpět ve Filadelfii Kenyatta pokračoval ve svém aktivismu. V roce 1969 byl zvolen národním viceprezidentem Černošské konference pro hospodářský rozvoj, která si jako svůj hlavní dokument stanovila Černošský manifest, v němž mimo jiné požadovala odškodnění černochů.
Bojkot Harvardovy univerzityRedakce
Kenyatta se v harvardské komunitě proslavil jako organizátor celonárodně kontroverzního bojkotu kurzu občanských práv na právnické fakultě. Bojkot byl protestem proti jmenování Jacka Greenberga, ředitele-poradce Fondu právní ochrany NAACP, spoluvyučujícím předmětu „Rasová diskriminace a občanská práva“. Tento kurz předtím vedl Derrick Bell, jeden z mála černošských členů právnické fakulty, který v roce 1981 Harvard opustil a stal se děkanem právnické fakulty Oregonské univerzity. Studenti doufali, že vedení právnické fakulty doplní svůj 58členný profesorský sbor, složený z jedné ženy a jednoho černocha, o člena z menšiny. Místo toho Harvard jmenoval bílého profesora Greenberga a J. Levonne Chamberse, černošského prezidenta fondu NAACP.
Jako předseda Asociace černošských studentů práv (BLSA) byl Kenyatta aktivním mluvčím bojkotu uvnitř i vně Harvardu. Menšinové skupiny si ho vybraly, aby napsal dopis vysvětlující bojkot Greenbergovi a Chambersovi. Děkan právnické fakulty James Vorenberg poslal kopii tohoto dopisu spolu s návrhem obsahujícím jeho vlastní postoj proti bojkotu studentům práv. Celostátní média z něj citovala v článcích o bojkotu, z nichž většina kritizovala bojkotující studenty za to, co jeden publicista nazval „banálním etnocentrismem“.
Kenyatta byl rozzloben tím, co považoval za lhostejnost k problémům menšin na právnické fakultě, a měl výhrady k učitelům, kteří „reprezentují strategie občanských práv z 50. let“.
Kenyatta se domníval, že spor o afirmativní akce na právnické fakultě je pouze součástí celostátního problému. Domníval se, že nejdůležitějším problémem černochů v Americe byly v té době ekonomické otázky a že afirmativní akce byla „klíčovým konceptem“, který měl černochům pomoci uniknout chudobě.
Kandidatura na starostu FiladelfieRedakce
Kenyatta se v roce 1975 ucházel o demokratickou nominaci na starostu Filadelfie. V té době se Frank L. Rizzo – kterého Kenyatta nazval „Georgem Wallacem ze severu“ – ucházel o znovuzvolení a o stranickou nominaci ho vyzval bílý liberální senátor Louis G. Hill. Hill počítal s podporou černošského obyvatelstva města, aby Rizza porazil.
Kenyatta Hilla nepodpořil a sám se ucházel o demokratickou nominaci. Filadelfská média věnovala jeho kandidatuře velkou pozornost, mimo jiné proto, že právě dokončil velmi medializovanou občanskou kampaň proti černošské mafii, která ve městě obchodovala s drogami. Ačkoli Kenyatta prohlásil, že do volebního klání vstoupil, protože si nemyslel, že by Hill byl lepší než Rizzo, kritici ho obvinili, že záměrně rozdělil hlasy černochů, aby Rizzo vyhrál. Kenyatta popřel, že by s Rizzem uzavřel nějaké dohody výměnou za svou protestní kandidaturu, nicméně obvinění ze spolčení bylo podpořeno skutečností, že dva z jeho blízkých přátel byli jmenováni do protekčních funkcí v Rizzově administrativě.
Mezinárodní práceRedakce
Kenyatta byl místopředsedou Pan African Skills Project, mezinárodního vzdělávacího programu zahrnujícího Spojené státy, Tanzanii a Ghanu, a byl stálým zástupcem v sekci nevládních organizací OSN. Pomáhal organizovat západní newyorskou pobočku TransAfrica, washingtonské lobbistické skupiny pro zájmy afrických a karibských zemí.