感染症に対する感受性が高いため、抗生物質は新生児に最も広く使用されている薬物である。 しかし、抗生物質の使用結果は、子宮内生活から子宮外生活への微妙な適応過程を特徴とする新生児の特異な生理学に強く影響される場合がある。 さらに、妊娠年齢、出生時体重、子宮内発育制限、年齢、特に腎臓と肝臓の機能が未熟であることも、抗生物質治療に影響を与える重要な要因である。 したがって、投与量、投与時期および投与経路は、バイオアベイラビリティ、分布、代謝、生体内変換および排泄の新生児期の変動を慎重に考慮する必要がある。 投与量と治療期間の微調整は、薬物動態学的および薬力学的パラメータに基づいて行う必要がある。 敗血症の病因が大きく異なるにもかかわらず、全身性感染が疑われる場合の最良の初期経験的治療法は、数年前と同様、アンピシリンとゲンタマイシンの併用療法であることに変わりはない。 セファロスポリン、カルバネペム、グリコペプチドなど、非常に有効で有用な抗生物質は、最大限の効果と最小限の毒性を得るために、使用制限の勧告に従って、乳児に慎重に投与する必要がある。 最後に，マクロライド系抗生物質は，その特殊性から，近年，抗菌作用とは異なる適応症が提唱されている。 早産児の消化管運動障害の治療にエリスロマイシンを経口投与すると、非経口栄養による胆汁うっ滞の発生を50％近く減らすことができた。また、アジスロマイシンは、抗生物質と抗炎症作用を併せ持ち、極低出生体重児における気管支肺異形成の予防のためのパイロットスタディで使用することに成功した。