アンモニウム化は、微生物、植物、および動物のバイオマスの有機結合窒素がそれらの死の後にリサイクルされるプロセスである。 アンモニア化は、生態系崩壊サービスを行う多様な微生物によって行われ、その生成物はアンモニアまたはアンモニウムイオンです。 アンモニウムは、多くの種類の植物、特に酸性土壌に生息する植物の栄養源として適している。
硝酸塩は、硝化として知られる重要な細菌プロセスによってアンモニウムから合成される。 硝化の最初のステップは、アンモニウムを亜硝酸塩（NO- 2 ）に酸化することで、これはニトロソモナス属の細菌によって行われる機能である。 亜硝酸塩は、ニトロバクター属の細菌によって、さらに急速に酸化され硝酸塩になります。 硝化を司るバクテリアは酸性に非常に弱いため、酸性の土壌や水ではこのプロセスはあまり起こりません。 このため、酸性の環境に生息する植物は、窒素栄養源としてアンモニウムを利用する能力が必要なのである
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