骨髄移植は輸血のように平均2時間程度の短時間で行われます。 この新しい骨髄は前駆細胞と呼ばれる細胞が豊富で、いったん血流に乗って循環し、骨髄にとどまって発育していきます。
患者さんは自分の骨髄を破壊する治療を受けた後、ドナーから健康な骨髄細胞を受け取ることになるのです。 ドナーから採取されたこれらの細胞は、骨髄凍結保存バッグに入れられ、凍結された後、特別な条件下（温度計付きサーモケース、4℃から20℃の間で管理）で、移植が行われる場所まで輸送されます。
また、患者さんに注入する細胞は、治療前に取り出したご自身の骨髄を後で使用するために凍結したもの（自家移植の場合）、臍帯血（関連提供や公的臍帯血バンクの細胞単位を使用する場合）であっても構いません。
これらの細胞が、正常な速度を維持するのに十分な白血球や赤血球、血小板をまだ作り出すことができない期間、患者は感染性のエピソードや出血にさらされることが多くなります。 そのため、彼は病院で隔離されたままである。