メタゲノムによるウイルス発見:その可能性

過去100年間、新しいウイルスの発見は徐々に進行してきた。 ウイルスは、電子顕微鏡やウイルス培養などの一連の技術を使って、一つずつ説明されてきた。 研究者は通常、生物内の疾患状態に関心を持ち、ウイルスの生態を探ることは稀であった。 しかし、ハイスループットなシーケンサーを用いたメタゲノム解析の登場は、ウイルスの発見率だけでなく、発見の内容にも大きな変革をもたらした。 例えば、現在では、多くの疾病がウイルスに起因しており、非病原性のウイルス性常在菌が至る所に存在し、環境中のウイルス群の記述も進展している。 ウイルスメタゲノミクスにはどのような実験的アプローチや解析パイプラインが存在するのか? いつになったら新規ウイルスゲノムを同定したと確信できるのか? 何をもってウイルスゲノムとするかという現在のルールは時代遅れなのでしょうか? ウイルスゲノムの組換えは、どの程度、信頼できるアセンブリを脅かすのか? 新しいウイルス遺伝子の機能をどのようにして注釈付け、理解することができるのか? 高次のプロセスにおける新発見のウイルスの役割をどのように決定するか? メタゲノム解析のアプローチを臨床の場でどのように実践するか? 宿主に関連するウイルス群集の構成から、その宿主の健康状態について何がわかるか? ウイルス群集の構成は、時間的・空間的にどの程度安定しているのか? そしてもちろん、メタゲノム解析によって、ウイルス宇宙からどのような真珠が発見されたのでしょうか?
この研究テーマでは、実験グループとバイオインフォマティックグループの両方から原著論文を募集します。 また、メタゲノムによるウイルス探索の最前線から、上記の疑問やその他のホットなトピックを取り上げたレビューや展望にも若干のスペースを確保する予定である。

重要な注意事項:この研究トピックへの投稿はすべて、投稿するセクションやジャーナルのミッションステートメントに定義された範囲内のものでなければなりません。 Frontiersは、査読のどの段階においても、範囲外の原稿をより適切なセクションまたはジャーナルに誘導する権利を留保します。

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