Questa pagina riassume i dati ottici di assorbimento ed emissione del 4′,6-Diamidino-2-fenilindolo, disponibili nel pacchetto PhotochemCAD, versione 2.1a (Du 1998, Dixon 2005). Ho rielaborato i loro dati per produrre questi grafici interattivi e per fornire collegamenti diretti ai file di testo che contengono i dati grezzi e manipolati. Anche se ho cercato di fare attenzione, potrei aver introdotto alcuni errori; si consiglia all’utente prudente di confrontare i risultati con le fonti originali.
È possibile ridimensionare qualsiasi grafico cliccando e trascinando un rettangolo. Se passate il mouse sopra il grafico, vedrete un pop-up che mostra le coordinate. Una delle icone nell’angolo in alto a destra vi permetterà di esportare il grafico in altri formati.
Assorbimento
Questa misura di assorbimento ottico di 4′,6-Diamidino-2-fenilindolo, sono state fatte da R.-C. A. Fuh nell’estate del 1997 utilizzando un Cary 3. I valori di assorbimento sono stati raccolti utilizzando una larghezza di banda spettrale di 1,0 nm, un tempo di media del segnale di 0,133 sec, un intervallo di dati di 0,25 nm, e una velocità di scansione di 112,5 nm/min.
Queste misure sono state scalate per rendere il coefficiente di estinzione molare corrispondente al valore di 27.000cm-1/M a 344.0nm (Haugland, 1992).
Dati originali |Dati di estinzione
Fluorescenza
Lo spettro di emissione di fluorescenza del 4′,6-Diamidino-2-fenilindolo, sciolto in acqua. La lunghezza d’onda di eccitazione era 350nm. La resa quantica di questa molecola è 0,043 (Härd, 1990). Questo spettro è stato raccolto da nell’estate del 1997 utilizzando uno Spex FluoroMax. I monocromatori di eccitazione e di emissione sono stati impostati a 1 mm, dando una larghezza di banda spettrale di 4,25 nm. L’intervallo di dati era di 0,5 nm e il tempo di integrazione era di 2,0 sec.
I campioni sono stati preparati in celle di quarzo di 1 cm di lunghezza del percorso con assorbanza inferiore a 0,1 all’eccitazione e a tutte le lunghezze d’onda di emissione per illuminare uniformemente il campione ed evitare l’effetto filtro interno. I conteggi al buio sono stati sottratti e gli spettri sono stati corretti per la sensibilità dello strumento dipendente dalla lunghezza d’onda.
Dati originali | Dati di emissione
Note
Non siamo riusciti a registrare uno spettro di fluorescenza, quindi nessun file è incluso.
Dixon, J. M., M. Taniguchi e J. S. Lindsey (2005), “PhotochemCAD 2. A Refined Program with Accompanying Spectral Databases for Photochemical Calculations, Photochem. Photobiol., 81, 212-213.
Du, H., R.-C. A. Fuh, J. Li, L. A. Corkan e J. S. Lindsey (1998) PhotochemCAD: Uno strumento di ricerca e progettazione assistita dal computer in fotochimica. Photochem. Photobiol. 68, 141-142.
Haugland, R. P. (1992-1994) Molecular Probes. Handbook of Fluorescent Probes and Research Chemicals.
HÒ¤rd, T., P. Fan and D. R. Kearns (1990) A fluorescence study of the binding of Hoechst 33258 and DAPI to halogenated DNAs. Photochem. Photobiol. 51, 77-86.