A bazális ganglionok caudate-putamenje és a nucleus accumbens (vagy tulajdonképpeni striatum) GABAerg projekciós neuronokat tartalmaz, amelyek rágcsálókban a striatum összes neuronjának mintegy 90%-át képviselik (Gerfen, 1992; 2004; Medina, 2008b; Parent and Hazrati, 1995a; Reiner et al., 1998). Amint fentebb említettük, az egérre vonatkozó adatok arra utalnak, hogy a striatum legtöbb, ha nem az összes projekciós neuronja a vLGE-ből származik (Marín és mtsai., 2000; Stenman és mtsai., 2003a). Mindazonáltal jelenleg nem zárhatjuk ki annak lehetőségét, hogy a striatum egyes neuronális alpopulációi a dLGE-ből származnak (például egyes tapaszneuronok , lásd alább). A striatumban a projekciós neuronoknak két fő altípusa van (7.7A ábra): ezek fele GABA-t és a substance P/dynorphin neuropeptideket (GABA/SP/DYN), míg a másik fele GABA-t és az enkefalin neuropeptidet (GABA/ENK) tartalmazza. Mindazonáltal találunk néhány példát olyan projekciós neuronokra, amelyek a substance P, a dinorfin és/vagy az enkefalin kombinációját együttesen tartalmazzák (ez ritkábban fordul elő a caudate-putamenben, mint a nucleus accumbensben; áttekintés: Gerfen, 2004; Medina, 2008b; Reiner et al., 1998). A projekciós neuronok e két típusa különbözik a projekcióik és funkcióik tekintetében (7.7B ábra), amint azt külön fejezetben kifejtettük és máshol áttekintettük (Gerfen, 2004; Medina, 2008b; Parent et al., 1995a,b; Reiner et al., 1998; lásd még e könyvnek a bazális ganglionok funkcionális vonatkozásairól szóló fejezetét). Például a caudate-putamen SP-tartalmú neuronjai elsősorban a globus pallidus belső szegmensébe és a substantia nigrába vetülnek, és részt vesznek az akaratlagos mozgások elősegítésében, míg az ENK-tartalmú neuronok a globus pallidus külső szegmensébe vetülnek, és részt vesznek az akaratlan mozgások blokkolásában (7.7B ábra). Nem ismert, hogy a substance P- vagy az enkefalin-tartalmú projekciós striatális neuronok különböző LGE alterületekről, vagy ugyanabból az alterület(ek)ből származnak-e különböző időpontokban. Érdekes módon e kétféle projekciós neuron differenciálódását különböző genetikai kaszkádok/hálózatok szabályozzák, amelyekben az SP-tartalmú neuronok esetében az Ebf1 transzkripciós faktor (Garel et al., 1999; Lobos et al., 2008), az ENK-tartalmú neuronok esetében pedig az Ikaros-1 (Agoton et al., 2007; Martín-Ibañez et al., 2010) vesz részt. A striatális projekciós neuronok e két típusa Huntington’;betegségben különböző időpontokban pusztul el (az ENK neuronok korábban halnak el, mint az SP neuronok), és ez a betegség különböző stádiumaiban eltérő motoros deficittel korrelál (áttekintés: Reiner et al., 1998). E két neuron-típus differenciálódásában szerepet játszó genetikai szabályozó programok vizsgálata segíthet e különbségek megértésében.