Marion Sinclair 1988-ban halt meg, így a dal az ausztrál szerzői jogi törvények szerint még mindig szerzői jogvédelem alatt áll. A kiadói jogokat a Larrikin Music birtokolja. Az Egyesült Államokban a jogokat a New York-i Music Sales Corporation kezeli.
2009 júniusában a Larrikin Music beperelte a Men at Work zenekart szerzői jogok megsértése miatt, azt állítva, hogy a zenekar 1981-es “Down Under” című kislemezének fuvola riffjének egy részét a “Kookaburra”-ból másolták. Ez a kereset a Spicks and Specks egyik epizódját követte, ahol ez a felhasználás volt egy panelkérdés alapja. A zenekar lemezkiadójának és kiadóvállalatának (Sony BMG Music Entertainment és EMI Songs Australia) ügyvédje azt állította, hogy a dal megírásának alapjául szolgáló megállapodás alapján a szerzői jog valójában a Girl Guides Association-t illeti meg. 2009. július 30-án az ausztrál szövetségi bíróság bírája, Peter Jacobson előzetes döntést hozott arról, hogy a dal szerzői joga valóban a Larrikiné, de azt a kérdést, hogy a dalszerzők, Colin Hay és Ron Strykert plagizálták-e a riffet, egy későbbi időpontban fogják eldönteni. 2010. február 4-én Jacobson bíró kihirdette ítéletét, amely szerint a Men at Work megsértette Larrikin szerzői jogait, és a bírósághoz benyújtott mindkét felvétel “… a Kookaburra jelentős részét reprodukálja”. A Larrikin ezt követően a bírósághoz fordult, hogy a dal 1981-ig visszamenőleg járó jogdíjak 40-60 százalékát megkapja, de 2010. július 6-án Jacobson bíró a 2002-ig visszamenőleg járó jogdíjak 5 százalékát ítélte meg a társaságnak – vélhetően hat számjegyű összeget.
2011. március 31-én Arthur Emmett, Jayne Jagot és John Nicholas bírák elutasították az EMI lemezkiadó cég fellebbezését, és megállapították, hogy a “Kookaburra Sits in the Old Gum Tree” című dallam szerzői jogait megsértették. A zenekar egyik dalszerzője, Colin Hay utólag úgy nyilatkozott, hogy az eredmény csalódást okozott, és az ítélet alaposabb felülvizsgálata után átgondolják álláspontjukat. 2011 októberében a zenekar elvesztette utolsó bírósági próbálkozását, amikor az ausztrál legfelsőbb bíróság elutasította a fellebbezést.