Análisis molecular de las mutaciones del gen de la beta-globina entre los niños tailandeses con beta-talasemia: resultados de un estudio de un solo centro

Introducción

La talasemia es el trastorno sanguíneo hereditario más común en el sudeste asiático y está causada por una síntesis reducida o ausente de las cadenas de globina de la hemoglobina (Hb) que conduce a un desequilibrio de las mismas.1,2 La beta-talasemia es uno de los principales tipos de talasemia y está causada por una mutación en el gen de la beta-globina (HBB) en el cromosoma 11. El espectro clínico y hematológico de la beta-talasemia va desde el portador silencioso hasta las condiciones clínicamente manifiestas, incluyendo la beta-talasemia mayor dependiente de transfusiones y la beta-talasemia intermedia (TI).3,4 En Tailandia, tanto la beta-talasemia como la hemoglobina E (HbE) representan una de las formas más comunes distribuidas en todas las regiones, especialmente en el noreste de Tailandia. La mayoría de las beta-talasemias graves son el resultado de la interacción de la beta-talasemia y la HbE.5,6

La base molecular de la talasemia se ha estudiado en todo el mundo. Se han caracterizado más de 300 mutaciones diferentes del gen de la beta-globina. La mayoría de las mutaciones de la beta-talasemia están causadas por mutaciones puntuales, pequeñas deleciones o inserciones dentro de las regiones codificantes y las uniones exón-intrón. Los tipos de mutación suelen ser específicos de cada etnia.7-9 En Tailandia, la prevalencia de portadores de beta-talasemia varía entre el 3% y el 9%.10 Hasta la fecha, se han identificado más de 30 mutaciones diferentes.11-13 La heterogeneidad de las mutaciones dificulta la identificación de la mutación en algunos pacientes con beta-talasemia. Para identificar las mutaciones del gen de la beta-globina se han utilizado ampliamente diversas técnicas de análisis del ADN, como el análisis de dot blot, el dot blot inverso, la amplificación específica del alelo mediante el sistema de mutación refractaria a la amplificación (ARMS) o la secuenciación directa del ADN.14-17

Este estudio tenía como objetivo caracterizar las mutaciones del gen de la beta-globina en 80 pacientes pediátricos portadores de mutaciones de beta-talasemia que fueron objeto de seguimiento en el Hospital Phramongkutklao, un centro de atención terciaria para pacientes con talasemia de todas las regiones, especialmente del centro de Tailandia.

Pacientes y métodos

Selección de pacientes

Se inscribieron en nuestro estudio ochenta pacientes de beta-talasemia no emparentados que acudieron a la Clínica de Hematología del Departamento de Pediatría del Hospital Phramongkutklao, Bangkok, Tailandia, desde enero de 2013 hasta diciembre de 2013. El protocolo del estudio fue aprobado por la Junta de Revisión Institucional del Hospital Phramongkutklao, Facultad de Medicina de Phramongkutklao, Tailandia. Sesenta y cinco pacientes tenían beta-talasemia clínicamente manifestada, incluyendo 57 con beta-talasemia/HbE y ocho con beta-talasemia homocigota o heterocigota compuesta. Quince pacientes tenían beta-talasemia heterocigótica. Todos los pacientes fueron diagnosticados a los 18 años o menos. Los pacientes con beta-talasemia homocigótica y beta-talasemia/HbE se clasificaron clínicamente en talasemia grave dependiente de transfusiones y en IT leve, basándose en criterios como la edad en el momento de la presentación, el nivel medio de Hb en el estado estacionario y el historial de frecuencia de transfusiones, tal y como se ha descrito previamente.18

Análisis de mutaciones

Tras obtener el consentimiento informado, se recogieron un total de 80 muestras de sangre periférica de ácido etilendiaminotetracético (EDTA) de todos los individuos. El ADN genómico se extrajo de los linfocitos de sangre periférica utilizando un kit de minipreparación de ADN genómico sanguíneo AxyPrep™ según el protocolo del fabricante. Las mutaciones del gen de la beta-globina se caracterizaron primero utilizando dos conjuntos de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) específicos para cada alelo o el sistema de mutación refractaria de amplificación múltiple (M-ARMS) para detectar siete mutaciones comunes en las poblaciones chinas y del sudeste asiático, incluyendo el codón 41/42 (-TCTT) el codón 17 (A>T), el nucleótido -28 (A>G), el IVS-II-654 (C>T), el codón 71/72 (+A), el IVS-I-1 (G>T) y el IVS-I-5 (G>C), como se ha descrito anteriormente.15,17 Se ha descubierto que estas mutaciones son responsables del 80%-90% de los alelos de beta-talasemia en esta región.19,20 Los genes de beta-talasemia desconocidos se caracterizaron además mediante la secuenciación directa del ADN de todas las regiones codificantes y de los límites exón-intrón para detectar mutaciones puntuales poco comunes y pequeños reordenamientos en el gen de la beta-globina de acuerdo con los protocolos descritos previamente en otro lugar.16 Los alelos de beta-talasemia que permanecieron sin caracterizar por los métodos de M-ARMS y de secuenciación de ADN mencionados anteriormente se examinaron posteriormente mediante gap-PCR para detectar la deleción de 3,4 kb de todo el gen de la beta-globina, previamente reportada en poblaciones tailandesas.21

Resultados

Se incluyeron en nuestro estudio un total de 88 alelos de beta-talasemia procedentes de ocho pacientes de beta-talasemia homocigotos o heterocigotos compuestos, 57 pacientes de beta-talasemia/HbE y 15 individuos de beta-talasemia heterocigotos. Los 80 sujetos procedían de familias no emparentadas y el 93,8% (75/80) de los sujetos vivían en Bangkok y otras provincias del centro de Tailandia. De estos 65 pacientes que tenían beta-talasemia clínicamente manifestada, el 92,3% (60/65) y el 7,7% (5/65) de los pacientes presentaban beta-talasemia mayor y TI, respectivamente. En los 60 pacientes con beta-talasemia mayor, el 86,7% (52/60) de los pacientes tenían beta-talasemia/HbE mientras que sólo el 13,3% (8/60) de los pacientes tenían beta-talasemia homocigota o heterocigota compuesta. Por otra parte, todos los pacientes con beta-talasemia homocigota o heterocigota compuesta y el 91,2% (52/57) de los pacientes con beta-talasemia/HbE de este estudio presentaban una beta-talasemia mayor grave dependiente de transfusiones. En cuanto al genotipo de los pacientes con beta-talasemia mayor, el genotipo más común fue el codón 41/42 (-TCTT)/codón 26 (G>A) o betaE, con un 40%, y el segundo más común fue el codón 17 (A>T)/betaE, con un 18%.El segundo más frecuente fue el codón 17 (A>T)/betaE, que representó el 18,3% de todos los genotipos de beta-talasemia mayor (Tabla 1 y Figura 1).

Tabla 1 Genotipo de 65 pacientes con beta-talasemia clínicamente manifestados
Abreviaciones: HbE, hemoglobina E; Hb, hemoglobina.

Figura 1 Tipo de genotipo en pacientes con beta-talasemia.
Abstáculos: Hb, hemoglobina.

Para dilucidar la base molecular de estos 88 alelos de beta-talasemia, primero caracterizamos el ADN de cada paciente mediante dos conjuntos de M-ARMS. Setenta y cinco alelos (85,2%) fueron identificados por este método, incluyendo 33 alelos (37,5%) del codón 41/42 (-TCTT), 23 alelos (26.1%) del codón 17 (A>T), siete alelos (8%) de IVS-I-5 (G>C), seis alelos (6,8%) de IVS-II-654 (C>T), cuatro alelos (4,5%) de IVS-I-1 (G>T) y dos alelos (2,3%) del codón 71/72 (+A) (Tabla 2). Curiosamente, el nucleótido -28 (A>G) no fue identificado en nuestro estudio. En 13 alelos (14,8%), ninguno de los dos conjuntos reveló la mutación de la beta-talasemia. Por lo tanto, la secuenciación directa del ADN de los tres exones codificantes y de las uniones exón-intrón flanqueantes en el gen de la beta-globina fue el siguiente paso para caracterizar estos 13 alelos. Se detectaron seis mutaciones poco comunes en nueve alelos (10,2%), incluyendo cuatro alelos (4,5%) del codón 35 (C>A) y un alelo (1,1%) para la mutación del codón de iniciación (ATG>AGG), el codón 15 (G>A), el codón 19 (A>G), el codón 27/28 (+C) y el codón 123/124/125 (-ACCCCACC), respectivamente (Figura 2). Los alelos restantes, no caracterizados por M-ARMS y secuenciación de ADN, se identificaron además mediante gap-PCR para detectar una deleción de 3,4 kb y esta deleción se encontró en los cuatro alelos restantes (4,5%).

Tabla 2 La frecuencia de las mutaciones de la beta-talasemia en 88 alelos
Abstáculos: Hb, hemoglobina.

Figura 2 Seis mutaciones poco comunes identificadas por secuenciación directa del ADN.
Notas: (A) Codón 35 (C>A). (B) Mutación del codón inicial (ATG>AGG). (C) Codón 15 (G>A). (D) Codón 19 (A>G). (E) Codón 27/28(+C). (F) Codón 123/124/125 (-ACCCCACC).

En total, el 100% de nuestros 88 alelos de beta-talasemia fueron caracterizados por una combinación de estas técnicas, incluyendo dos conjuntos de M-ARMS, secuenciación directa de ADN y gap-PCR de detección de deleción de 3,4 kb. Excluyendo el gen de la betaE-globina, se encontraron 13 mutaciones diferentes de beta-talasemia en el presente estudio. La deleción de 4 pb (-TCTT) en los codones 41/42 fue la mutación más común identificada en nuestro estudio y representó el 37,5% de los alelos. El codón 17 (A>T) fue el segundo más común y representó el 26,1% de los alelos. En conjunto, estas dos mutaciones comunes representaron más de la mitad (63,6%) de los alelos afectados. Todas las demás mutaciones comunes, excepto el nucleótido -28 (A>G), representaron el 21,6% de los alelos.

Discusión

Este estudio proporcionó información útil sobre la distribución de la frecuencia de las mutaciones de la beta-talasemia entre los pacientes pediátricos, especialmente en el centro de Tailandia, ya que más del 90% de los pacientes vivían en Bangkok y otras provincias de esta región. En total, el 92% de los niños que tenían beta-talasemia clínicamente manifestada tenían el fenotipo de beta-talasemia mayor y más del 85% de los pacientes pediátricos con beta-talasemia mayor tenían beta-talasemia heterocigota compuesta y HbE, que es altamente prevalente en Tailandia.5,6,8,10 La frecuencia del gen de la globina betaE no se incluyó en el análisis de la frecuencia de mutaciones de la beta-talasemia, ya que la HbE puede detectarse fácilmente mediante electroforesis de la Hb.

Varios métodos pueden determinar las mutaciones de la beta-talasemia.14-17 Este estudio reveló que M-ARMS detectó siete mutaciones comunes en poblaciones chinas y del sudeste asiático y fue capaz de detectar el 85,2% de los alelos como en informes anteriores.19,20 Dado que M-ARMS sólo puede detectar un conjunto determinado de mutaciones específicas de los cebadores empleados, la secuenciación directa del ADN es el siguiente paso para identificar varias mutaciones puntuales y pequeños reordenamientos en el gen de la beta-globina. Se identificaron seis mutaciones menos frecuentes en el 10,2% de los alelos. El inconveniente de la secuenciación del ADN es que las grandes deleciones del gen son indetectables. Por lo tanto, la gap-PCR es el paso final para detectar la deleción de 3,4 kb, previamente reportada en poblaciones tailandesas.21 Una combinación de estas técnicas pudo identificar mutaciones de beta-talasemia en los 88 alelos (100%) de los pacientes pediátricos de nuestro estudio.

Excluyendo el gen de la betaE-globina, se detectaron 13 mutaciones diferentes de beta-talasemia en 80 pacientes no relacionados. Las dos mutaciones más comunes detectadas fueron el codón 41/42 (-TCTT) y el codón 17 (A>T), que representan el 37,5% y el 26,1% de los alelos afectados, respectivamente. Todas las demás mutaciones comunes detectadas por M-ARMS representaron el 21,6% de los alelos. En comparación con el estudio anterior sobre las mutaciones de la beta-talasemia en Tailandia, esto reveló que la frecuencia de las mutaciones del gen de la beta-globina identificadas en nuestro estudio era diferente. En primer lugar, el nucleótido -28 (A>G) no se identificó en nuestro estudio. El nucleótido -28 (A>G) es una mutación beta+-talasémica que causa el fenotipo de beta-talasemia leve; por lo tanto, esta mutación se ha observado sólo en pacientes con IT.22 El presente estudio demostró que la IT era el grupo minoritario (menos del 10%) entre los pacientes pediátricos con beta-talasemia sintomática. Esto puede explicar por qué no se observó esta mutación en nuestro estudio. En segundo lugar, la frecuencia de otras mutaciones comunes, incluyendo el codón 41/42 (-TCTT), el codón 17 (A>T), IVS-II-654 (C>T), el codón 71/72 (+A), IVS-I-1 (G>T) e IVS-I-5 (G>C) en nuestro estudio fue similar a la de otros estudios realizados en el centro de Tailandia.8,10 Sin embargo, la frecuencia alélica de este estudio fue diferente a la de los estudios realizados en otras partes de Tailandia. El codón 41/42 (-TCTT) fue la mutación más común identificada en nuestra población, que vivía principalmente en el centro de Tailandia. Esta mutación de cambio de marco es también la más común en otras partes de Tailandia, la República Popular China y el sudeste asiático.20 Mientras que el codón 17 (A>T) fue el segundo alelo mutado más común en el centro, el norte y el noreste de Tailandia, el IVS-I-5 (G>C) fue el segundo más común en el sur de Tailandia.23 El IVS-I-5 (G>C) se informó previamente como la mutación más común entre los pacientes musulmanes tailandeses en el sur de Tailandia.24 Además, el codón 71/72 (+A) representó el 2,3% en el presente estudio, mientras que esta mutación representó el 6% en el norte16 y el 13,1% en el noreste13 de Tailandia, lo que indica una mayor frecuencia de esta mutación en esta zona.

Seis mutaciones poco comunes, incluyendo el codón 35 (C>A), el codón 15 (G>A), el codón 19 (A>G) o Hb Malay, el codón 27/28 (+C), la mutación del codón de iniciación (ATG>AGG) y el codón 123/124/125 (-ACCCCACC) fueron identificados por secuenciación directa del ADN. Aunque no se detectó ninguna nueva mutación, en nuestro estudio se encontraron dos mutaciones poco frecuentes en Tailandia, la mutación del codón de iniciación y la deleción de 8 pb en el exón 3. La mutación del codón de iniciación (ATG>AGG) se describió por primera vez en un paciente chino con beta-talasemia en 1990.25 En Tailandia, esta mutación se informó una vez en 2005 en dos hermanos con beta-talasemia/HbE.26 Aunque esta mutación ha afectado seriamente a la síntesis de la cadena de beta-globina y muy probablemente causa el fenotipo de beta0-talasemia, los tres pacientes reportados tenían el fenotipo leve, que puede explicarse por la co-inherencia con el genotipo alfa-tal-2 de deleción heterocigota de 3,7 kb entre el paciente chino y la asociación con el polimorfismo C>T en el gen de la gamma-globina -158(G) en los dos hermanos tailandeses. El fenotipo de nuestro paciente era beta-talasemia mayor dependiente de transfusiones, diagnosticada a los 9 meses de edad, mientras que el genotipo era heterocigoto compuesto entre el codón 41/42 (-TCTT) y la mutación del codón de iniciación. Ambos alelos mutados causan el fenotipo de la beta0-talasemia. La deleción de ocho bases en el exón 3 o codón 123/124/125 (-ACCCCACC) se caracterizó por primera vez en niños del noreste de Tailandia con el fenotipo grave de beta-talasemia/HbE.27 Esta deleción da lugar a la síntesis de 135 aminoácidos de la cadena betaX (beta-Khon Kaen), que son muy inestables y se degradan poco después de la traducción. La alteración extensa de los aminoácidos en el codón 123 a 131 causó rasgos de beta-talasemia de cuerpo de inclusión dominante como en nuestro paciente.

La beta-talasemia/HbE es un problema importante de talasemia en Tailandia y puede asociarse a varios fenotipos clínicos que van desde la talasemia intermedia leve a la talasemia mayor dependiente de transfusiones.5,6,8,10 Al igual que en nuestro estudio, el 85% de los pacientes con beta-talasemia mayor y el 100% de los pacientes con IT tenían beta-talasemia y HbE heterocigotas compuestas. En la beta-talasemia mayor, el genotipo más comúnmente encontrado fue el codón 41/42 (-TCTT)/betaE (40%), seguido del codón 17 (A>T)/betaE (18,3%), IVS-I-5 (G>C)/betaE (8,3%) e IVS-II-654 (C>T)/betaE (8,3%), que constituyeron el 75% de todos los genotipos detectados. Excluyendo la mutación betaE-talasemia, todas las mutaciones de beta-talasemia en nuestros pacientes sintomáticos se clasificaron como mutación beta0 excepto el codón 19 (A>G) o Hb Malay, clasificado como mutación beta+ e identificado sólo en un paciente.28

Es interesante que nuestro paciente con el codón 19 (A>G)/betaE tuviera una manifestación de talasemia mayor dependiente de transfusiones en lugar de una IT leve. Por otro lado, los heterocigotos compuestos entre cuatro mutaciones beta0 que incluyen el codón 41/42 (-TCTT), el codón 17 (A>T), la deleción de 3,4 kb, IVSI-1 (G>T) y el genotipo betaE manifestaron IT en lugar de fenotipo de beta-talasemia mayor. Este fenómeno puede explicarse por varios factores genéticos y no genéticos, que pueden desempeñar papeles en la determinación de la variabilidad de la enfermedad.5,22,29,30 Sin embargo, en nuestro estudio no se realizó el análisis genético adicional (modificadores genéticos).

El concepto de diagnóstico genético preimplantacional es permitir la transferencia de embriones al útero en los procedimientos de reproducción asistida. Esta técnica es rápida y adecuada como herramienta clínica no invasiva para identificar trastornos genéticos con el fin de reducir los abortos espontáneos selectivos, como la talasemia mayor.31,32 Nuestro estudio reveló que las diferentes mutaciones de la beta-talasemia pueden aplicarse clínicamente al protocolo genético de preimplantación, permitiendo el análisis genético molecular para amplificar una región específica en el gen de la beta-globina para una pareja.

En conclusión, el presente estudio demuestra la heterogeneidad de los defectos moleculares que causan la beta-talasemia en los niños tailandeses. Todos los alelos de beta-talasemia se han caracterizado mediante una combinación de técnicas que incluyen M-ARMS, secuenciación directa del ADN y gap-PCR para la detección de deleciones de 3,4 kb. Trece mutaciones representaron el 100% de los genes de beta-talasemia en nuestro estudio. La frecuencia obtenida debería representar la frecuencia de las mutaciones del gen de la beta-globina entre los pacientes pediátricos, que vivían principalmente en el centro de Tailandia.

Agradecimiento

Este estudio fue aprobado por el Colegio de Medicina de Phramongkutklao y recibió financiación del mismo.

Divulgación

Los autores declaran no tener conflictos de intereses en este trabajo.

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