. Tento komplex hraje důležitou roli v drahách, které přeměňují energii z potravy na formu, kterou mohou buňky využít. Pyruvátdehydrogenázový komplex přeměňuje molekulu zvanou pyruvát, která vzniká rozkladem sacharidů, na jinou molekulu zvanou acetyl-CoA. Tato přeměna je nezbytná pro zahájení řady chemických reakcí, které produkují energii pro buňky.
Komplex pyruvátdehydrogenázy se skládá z několika kopií několika enzymů nazývaných E1, E2 a E3, z nichž každý provádí část chemické reakce, která přeměňuje pyruvát na acetyl-CoA. Kromě toho zajišťují správnou funkci komplexu další proteiny, které jsou jeho součástí. Jeden z těchto proteinů, vazebný protein E3, připojuje E3 ke komplexu a zajišťuje správnou strukturu komplexu, aby mohl plnit svou funkci. Další přidružené proteiny řídí aktivitu komplexu: pyruvátdehydrogenáza fosfatáza komplex zapíná (aktivuje), zatímco pyruvátdehydrogenáza kináza komplex vypíná (inhibuje).
Enzym E1, nazývaný také pyruvátdehydrogenáza, se skládá ze čtyř částí (podjednotek): dvou podjednotek alfa (nazývaných E1 alfa) a dvou podjednotek beta (nazývaných E1 beta). Nejčastější příčinou nedostatku pyruvátdehydrogenázy jsou mutace v genu PDHA1, který poskytuje instrukce pro tvorbu E1 alfa, což představuje přibližně 80 % případů. Tyto mutace vedou k nedostatku proteinu E1 alfa nebo mají za následek vznik abnormálního proteinu, který nemůže správně fungovat. Snížení funkčního proteinu E1 alfa vede ke snížené aktivitě komplexu pyruvátdehydrogenázy.
Deficitu pyruvátdehydrogenázy se účastní i další složky komplexu pyruvátdehydrogenázy. U osob s tímto onemocněním byly zjištěny mutace v genech, které poskytují instrukce pro enzym E1 beta (gen PDHB), enzym E2 (gen DLAT), vazebný protein E3 (gen PDHX) a pyruvátdehydrogenázovou fosfatázu (gen PDP1). Ačkoli není jasné, jak mutace v každém z těchto genů ovlivňují komplex, zdá se, že snížená funkce jedné složky komplexu zhoršuje aktivitu celého komplexu. Stejně jako v případě mutací genu PDHA1 vedou změny v těchto dalších genech ke snížení aktivity komplexu pyruvátdehydrogenázy.
Při snížené funkci tohoto komplexu se pyruvát hromadí a další chemickou reakcí se přeměňuje na kyselinu mléčnou. Nadbytek kyseliny mléčné způsobuje u postižených jedinců laktátovou acidózu. Kromě toho je snížena produkce buněčné energie. Mozek, který potřebuje obzvláště velké množství energie, je vážně postižen, což vede k neurologickým problémům spojeným s nedostatkem pyruvátdehydrogenázy.