Komplekset har vigtige naturlige og arkitektoniske dele, som har deres egne betydninger og historier, herunder:
Tårnene:
De kaldes Muyuccmarca, Paucarmarca, Sallaqmarca og er placeret på toppen af bastionerne (zigzagmure).I inkaernes tid var de tårne arrangeret i en lige linje på toppen af bakken; dette sted havde rigeligt med vand, i dag kan vi i øvrigt stadig se en del af akvædukterne.
Muyucmarca kommer fra Quechua-sproget: “Muyuq” betyder rund, “Marca” = befolkning. På de genopdagede sokler kan man se en cirkulær figur med tre koncentriske cirkler, der alle er indsat i et kvadrat med ulige sider.
Paucarmarca: sydsiden af Sayaqmarca, er dækket af jord, kan muligvis være firkantet, etymologisk betyder “Pauca”: livlig, smuk, munter, have og “Brand” befolkning. Det menes at have været dedikeret til stjernerne
Sallaqmarca:Ligger ved siden af Muyuccmarca, etymologisk betyder “Sallaq”: ru, stenet, “Marca” betyder: befolkning.I øjeblikket er der kun fundamenterne af tårnene, bygningerne blev ødelagt i koloniens tidlige dage,deres fundamenter dækket med jord, og senere lokaliseret og genfundet af dr. Luis E. Valcárcel.
Gruppe af indhegninger:
De kalder “Bastioner” de 3 platforme, der danner en tandformet form af indløb og fremspring dannet af vægge lavet af blokke af kalksten, imponerende uregelmæssige polyedre samlet til perfektion. Den første spanske konstruktion tilskrev bygningen til dæmoner, selv i dag siger man, at det er rumvæsener, der har lavet dette værk. Disse forsvarsværker betragtes som et vidunder i hele verden.
Bastionerne:
De kalder “bastioner” de 3 platforme, der danner en tandformet form af indløb og fremspring dannet af vægge lavet af blokke af kalksten, imponerende uregelmæssige polyedre, der er samlet til perfektion. Den første spanske konstruktion tilskrev bygningen til dæmoner, selv i dag siger de, at det er rumvæsener, der har lavet dette værk. Disse forsvarsværker betragtes som et vidunder i hele verden.
Dørene:
Lokaliseret i midten af bastionerne, af trapezform, tjente de som indgang til området med tårnene. De tre døre, der omtales, er: T’iopunku, Ajawanapunku, Wiracochapunku.
Rutschebane eller Suchuna:
Geologisk set er det en naturlig formation af diorit af vulkansk oprindelse, der er opstået med modulerende krøller og riller på overfladen i form af rutsjebaner.
Inkaernes trone eller K’usillucJink’ian:
Disse ord kan oversættes til “hvor aben klatrer”. Det er en række sæder, der er hugget ind i klippen med en dyb æstetisk sans; den ligger i den østlige del af bakken.
Chincanas
Der er 2, den mindste, sammen med Warmi K´acchana er af kort længde og er blevet en distraktion for besøgende. Den store ligger længere mod nord, under en stor kalksten klippe. Passagen til store Chicana er ikke tilladt af nogen grund, da dem, der kom ind, ikke er vendt tilbage. Ifølge geologen Dr. Carlos Kalafatovich er disse tunneler, kaldet Chincanas, resultatet af erosion af grundvandet, der cirkulerede i grotterne. Krønikeskrivere som Guaman Poman de Ayala, Inka Garcilaso de la Vega og andre er dog enige om, at den store Chincana er en hemmelig tunnel med flere forbindelser til forskellige dele af Tahuantinsuyo. Historien fortæller, at en gruppe eventyrere udrustede sig og gik ind i denne Chincana; man vidste intet om dem i månedsvis, indtil en af dem en dag dukkede op i Santo Domingos tempel, som tidligere var Qorikancha, med en majskolbe af massivt guld i hånden. Det siges, at inkaerne under krigene ikke kunne holde op med at tilbede deres guder; derfor gik de gennem disse underjordiske indgange til Qorikancha for at deltage i ceremonierne og aflevere ofrene til deres guder.