Marion Sinclair døde i 1988, så sangen er stadig ophavsretligt beskyttet i henhold til den australske lov om ophavsret. Udgivelsesrettighederne indehaves af Larrikin Music. I USA administreres rettighederne af Music Sales Corporation i New York City.
I juni 2009 sagsøgte Larrikin Music bandet Men at Work for krænkelse af ophavsretten, idet Larrikin Music hævdede, at en del af fløjte-riffet i bandets single “Down Under” fra 1981 var kopieret fra “Kookaburra”. Denne sag fulgte efter et afsnit af Spicks and Specks, hvor denne brug var grundlaget for et spørgsmål i et panel. Advokaten for bandets pladeselskab og forlag (Sony BMG Music Entertainment og EMI Songs Australia) hævdede, at ophavsretten i henhold til den aftale, som sangen var skrevet i henhold til, faktisk tilhørte Girl Guides Association. Den 30. juli 2009 traf dommer Peter Jacobson fra den australske forbundsdomstol en foreløbig afgørelse om, at Larrikin havde ophavsretten til sangen, men at spørgsmålet om, hvorvidt sangskriverne Colin Hay og Ron Strykert havde plagieret riffet eller ej, ville blive afgjort på et senere tidspunkt. Den 4. februar 2010 afsagde dommer Jacobson sin dom, hvori han fastslog, at Men at Work havde krænket Larrikins ophavsret, og at begge de optagelser, der blev forelagt retten, “… gengiver en væsentlig del af Kookaburra”. Larrikin anmodede efterfølgende retten om at få mellem 40 og 60 procent af sangens royalties med tilbagevirkende kraft fra 1981, men den 6. juli 2010 tilkendte dommer Jacobson selskabet 5 procent af royalties med tilbagevirkende kraft fra 2002 – angiveligt et sekscifret beløb.
Den 31. marts 2011 blev en appel fra pladeselskabet EMI afvist af dommerne Arthur Emmett, Jayne Jagot og John Nicholas, som konkluderede, at der havde været tale om en krænkelse af ophavsretten til melodien “Kookaburra Sits in the Old Gum Tree”. En af bandets sangskrivere, Colin Hay, sagde bagefter, at resultatet var skuffende, og at de ville overveje deres holdning efter at have gennemgået dommen nærmere. I oktober 2011 tabte bandet sit sidste retssag, da High Court of Australia afviste at behandle en appel.