Bone Marrow Transplantation er en hurtig procedure, ligesom en blodtransfusion, som i gennemsnit varer 2 timer. Denne nye knoglemarv er rig på celler kaldet progenitorer, som, når de er kommet i blodbanen, cirkulerer og sætter sig fast i knoglemarven, hvor de udvikler sig.
Patienten vil efter at have gennemgået en behandling, der vil ødelægge hans egen knoglemarv, modtage sunde knoglemarvsceller fra en donor. Når disse celler er blevet indsamlet fra donoren, pakkes de i en pose til kryokonservering af knoglemarv, fryses ned og transporteres under særlige forhold (kontrolleret termokasse med termometer ved en temperatur på mellem 4 og 20 °C) til det sted, hvor transplantationen skal finde sted.
De celler, der infunderes til patienten, kan også være fra patientens egen marv, der er fjernet før behandlingen og frosset ned til senere brug (i tilfælde af autolog transplantation), eller fra navlestrengsblod (i tilfælde af beslægtet donation eller brug af en celleenhed fra de offentlige navlestrengsblodbanker).
I den periode, hvor disse celler endnu ikke er i stand til at producere tilstrækkeligt mange hvide og røde blodlegemer og blodplader til at holde blodprocenten inden for normalområdet, er patienten mere udsat for smittetilfælde og blødninger. Af denne grund forbliver han på hospitalet i isolation.