Et peptid er betegnelsen for korte polymerer af aminosyrer. De klassificeres efter antallet af aminosyreenheder i kæden, kaldet aminosyrerester. Tripeptider har tre aminosyrerester, mens tetrapeptider har fire aminosyrerester. Der dannes et polypeptid, når kæden af aminosyrerester er mere end flere dusin lang. Et protein er et molekyle, der består af en eller flere polypeptidkæder.
Proteiner er uforgrenede polymerer af aminosyrer, der er forbundet hoved til hale fra carboxylgruppe til aminogruppe gennem dannelse af kovalente peptidbindinger. Peptidryggen i et protein består af den gentagne sekvens.
-N-Ca- C, hvor N repræsenterer amidkvælstof, Ca repræsenterer a-kulstofatomet for en aminosyre i polymerkæden, og det sidste C er aminosyrens carbonylkulstof. Dette C er igen forbundet med amid-N i den næste aminosyre og så videre nedad i kæden. Den uforgrenede polypeptidkæde har to ender, en amino-terminal eller N-terminal ende og en carboxyl-terminal eller C-terminal ende.