En af fyrtårnets første vagter var en mand ved navn Peter Rasmussen. Han var kendt for sit omhyggelige øje og sin vagtsomme måde at vedligeholde fyrtårnet på. Han var også kendt for sin kærlighed til cigarer og er et af de første spøgelser, som folk fortæller, at de kom i kontakt med. I årenes løb er lugten af Peters cigar blevet registreret af mange, herunder ansatte og gæster.
Andre har set og hørt en anden vogter, Joseph Andreu, på toppen af tårnet; blot har han været død i mere end et århundrede. Hans tilstedeværelse i fyret kunne forklares ved, at han faldt i døden, mens han malede tårnets yderside. Hans ånd forlod aldrig stedet og ses ofte kigge ud fra toppen.
Men de måske mest kendte spøgelser fra St. Augustine Lighthouse er måske spøgelserne fra de to unge søstre, der også døde på ejendommen. Hezekiah Pity blev hyret til at renovere tårnet i slutningen af 1800-tallet. Hans døtre, Eliza og Mary, legede inde i en vogn, der blev brugt til at transportere materialer frem og tilbage til fyrtårnet. Da vognen gik løs, var de ikke i stand til at hoppe ud i tide, og vognen gled hurtigt ud i bugten og styrtede begge piger ned til en vandig død.
I dag og de fleste dage siden da kan man høre pigerne grine på toppen af tårnet sent om aftenen. Andre har set Eliza svæve rundt på området iført den samme blå kjole, som hun døde i.