4′,6-Diamidino-2-phenylindol, [DAPI]

Denne side opsummerer de optiske absorptions- og emissionsdata for 4′,6-Diamidino-2-phenylindol, der er tilgængelige i PhotochemCAD-pakken, version 2.1a (Du 1998, Dixon 2005). Jeg har bearbejdet deres data til at producere disse interaktive grafer og til at give direkte links til tekstfiler, der indeholder de rå og manipulerede data. Selv om jeg har forsøgt at være forsigtig, kan jeg have indført nogle fejl; den forsigtige bruger anbefales at sammenligne disse resultater med de originale kilder.

Du kan ændre størrelsen på alle graferne ved at klikke og trække et rektangel. Hvis du holder musen over grafen, vil du se en pop-up, der viser koordinaterne. Et af ikonerne i øverste højre hjørne giver dig mulighed for at eksportere grafen i andre formater.

Absorption

Denne optiske absorptionsmåling af 4′,6-Diamidino-2-phenylindol, blev foretaget af R.-C. A. Fuh i sommeren 1997 ved hjælp af en Cary 3. Absorptionsværdierne blev indsamlet ved hjælp af en spektral båndbredde på 1,0 nm, en signalmidlingstid på 0,133 sek., et datainterval på 0,25 nm og en scanningshastighed på 112,5 nm/min.

Disse målinger blev skaleret for at få den molære ekstinktionskoefficient til at stemme overens med værdien på 27.000cm-1/M ved 344.0nm (Haugland, 1992).

Original Data |Extinktionsdata

Fluorescens

Fluorescensemissionsspektret af 4′,6-Diamidino-2-phenylindol, opløst i vand. Excitationsbølgelængden var 350nm. Kvanteudbyttet for dette molekyle er 0,043 (HÃÂÃärd, 1990) Dette spektrum blev indsamlet af i sommeren 1997 ved hjælp af en Spex FluoroMax. Excitations- og emissionsmonokromatorerne blev indstillet på 1 mm, hvilket giver en spektral båndbredde på 4,25 nm. Dataintervallet var 0,5 nm, og integrationstiden var 2,0 sek.

Proverne blev fremstillet i kvartsceller med 1 cm pathlængde med en absorbans på mindre end 0,1 ved excitations- og alle emissionsbølgelængder for at opnå en ensartet belysning af hele prøven og for at undgå den indre filtereffekt. Mørketællingerne blev subtraheret, og spektrene blev korrigeret for bølgelængdeafhængig instrumentfølsomhed.

Original Data |Emission Data

Notes

Vi var ikke i stand til at optage et fluorescensspektrum, og der er derfor ingen fil inkluderet.

Dixon, J. M., M. Taniguchi og J. S. Lindsey (2005), “PhotochemCAD 2. A Refined Program with Accompanying Spectral Databases for Photochemical Calculations”, Photochem. Photobiol., 81, 212-213.

Du, H., R.-C., R.-C. A. Fuh, J. Li, L. A. Corkan og J. S. Lindsey (1998) PhotochemCAD: Et computerstøttet design- og forskningsværktøj inden for fotokemi. Photochem. Photobiol. 68, 141-142.

Haugland, R. P. (1992-1994) Molecular Probes. Handbook of Fluorescent Probes and Research Chemicals.

HÃÂÃärd, T., P. Fan og D. R. Kearns (1990) A fluorescence study of the binding of Hoechst 33258 and DAPI to halogenated DNAs. Photochem. Photobiol. 51, 77-86.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.