Peptid je název přiřazený krátkým polymerům aminokyselin. Klasifikují se podle počtu aminokyselinových jednotek v řetězci, kterým se říká aminokyselinové zbytky. Tripeptidy mají tři aminokyselinové zbytky, zatímco tetrapeptidy čtyři. Polypeptid vzniká, když délka řetězce aminokyselin přesáhne několik desítek zbytků. Protein je molekula složená z jednoho nebo více polypeptidových řetězců.
Proteiny jsou nerozvětvené polymery aminokyselin spojených od hlavy k ocasu od karboxylové skupiny k aminoskupině vytvořením kovalentních peptidových vazeb. Peptidová páteř proteinu se skládá z opakující se sekvence.
-N-Ca- C, kde N představuje amidový dusík, Ca představuje a-uhlíkový atom aminokyseliny v polymerním řetězci a konečné C je karbonylový uhlík aminokyseliny. Toto C je zase spojeno s amidovým N další aminokyseliny a tak dále po řadě. Nevětvený polypeptidový řetězec má dva konce, amino-terminální neboli N-terminální konec a karboxylový neboli C-terminální konec
.