Przez ostatnie sto lat odkrywanie nowych wirusów było procesem stopniowym. Wirusy były opisywane jeden po drugim przy użyciu zestawu technik takich jak mikroskopia elektronowa i hodowla wirusów. Badaczy interesował zwykle stan chorobowy w organizmie, a wyprawy w kierunku wirusowej ekologii były rzadkie. Pojawienie się metagenomiki wykorzystującej sekwencjonowanie o wysokiej wydajności zrewolucjonizowało nie tylko tempo odkrywania wirusów, ale także charakter tych odkryć. Na przykład, wiele więcej chorób można obecnie przypisać czynnikom wirusowym, niepatogenne komensale wirusowe są wszechobecne, a opis wirusów środowiskowych czyni postępy.
Jakie podejścia eksperymentalne i procedury analityczne istnieją dla metagenomiki wirusowej? Kiedy możemy być pewni, że zidentyfikowaliśmy nowy genom wirusowy? Czy obecne zasady określające co jest akceptowane jako genom wirusowy są przestarzałe? Jak bardzo rekombinacja wirusowych genomów zagraża wiarygodnemu montażowi? Jak możemy przypisać lub zrozumieć funkcje nowych genów wirusowych? Jak określić rolę nowo odkrytego wirusa w procesach wyższego rzędu? Jak podejście metagenomiczne może być zastosowane w warunkach klinicznych? Co skład społeczności wirusów związanych z gospodarzem mówi nam o stanie zdrowia tego gospodarza? Jak stabilny jest skład społeczności wirusowej w czasie i przestrzeni? I oczywiście: jakie perły z wirusowego wszechświata już odkryliśmy stosując metagenomikę?
Do tego tematu badawczego poszukujemy oryginalnych prac badawczych zarówno z grup eksperymentalnych jak i bioinformatycznych. Ponadto, zarezerwujemy również trochę miejsca na recenzje i perspektywy, które odnoszą się do pytań wymienionych powyżej lub innych gorących tematów z pogranicza dziedziny odkrywania wirusów za pomocą metagenomiki.
Ważna uwaga: Wszystkie prace w tym temacie badawczym muszą być zgodne z zakresem tematycznym działu i czasopisma, do którego zostały zgłoszone, jak określono w ich misjach. Frontiers zastrzega sobie prawo do przeniesienia manuskryptu spoza zakresu do bardziej odpowiedniego działu lub czasopisma na każdym etapie recenzji.