Przynależność religijna w Nigerii jest silnie związana z etnicznością, z dość wyraźnymi podziałami regionalnymi między grupami etnicznymi. Północne stany, zdominowane przez grupy Hausa i Fulani, są w przeważającej mierze muzułmańskie, podczas gdy południowe grupy etniczne mają dużą liczbę chrześcijan. Na południowym zachodzie nie ma dominującej religii. Plemię Yoruba, które jest większościową grupą etniczną na południowym zachodzie, praktykuje chrześcijaństwo, muzułmanizm i/lub tradycyjną religię Yoruba, która skupia się na wierze w jednego najwyższego boga i kilka pomniejszych bóstw.
Ogólne statystyki wskazują, że około 50% populacji to muzułmanie, z większością praktykującą sunnicką gałąź wiary. Około 40% jest chrześcijanami, a około 10% praktykuje tradycyjne religie afrykańskie lub nie wyznaje żadnej religii. Wielu ludzi
zawierają elementy tradycyjnych wierzeń w ich własnej praktyce chrześcijaństwa lub islamu. Społeczność chrześcijańska składa się z rzymskich katolików (największa denominacja), metodystów, anglikanów, baptystów, prezbiterian oraz członków grup ewangelikalnych i zielonoświątkowych.
Chociaż konstytucja zabrania państwowych i lokalnych rządów od deklarowania oficjalnej religii, kilka stanów przyjęło ostatnio różne formy islamskiego prawa karnego i cywilnego znanego jako Shari’ah, ruch, który wielu chrześcijan uważa za przyjęcie islamu jako religii de facto. Konstytucja przewiduje również wolność wyznania, jednak niektóre stany ograniczyły demonstracje, procesje i zgromadzenia religijne ze względu na bezpieczeństwo publiczne. Właściciele firm i urzędnicy państwowi są znani z dyskryminacji osób o innej wierze niż ich własna w kwestii świadczenia usług i zatrudniania pracowników. Ten sam rodzaj dyskryminacji istnieje między członkami różnych grup etnicznych. Niektóre święta chrześcijańskie i muzułmańskie są oficjalnie przestrzegane.
Istnieje wysoki stopień napięcia między chrześcijanami i muzułmanami z zapisem przemocy wobec obu grup. Konflikty mogą jednak wynikać przede wszystkim z różnic etnicznych i regionalnych, ponieważ istnieje szereg doniesień o aktach przemocy między różnymi grupami etnicznymi wyznającymi tę samą religię.