Les antibiotiques peuvent rendre le vaccin contre la grippe moins efficace en perturbant les microbes intestinaux

La prise d’antibiotiques pourrait-elle rendre une personne plus sensible à la grippe cette saison ? Une nouvelle petite étude de l’Université Stanford en Californie suggère que cela pourrait être le cas pour certaines personnes.

Selon une recherche publiée le 5 septembre 2019 dans la revue Cell, les scientifiques ont découvert qu’un traitement aux antibiotiques peut réduire l’efficacité du vaccin contre la grippe en tuant les microbes intestinaux qui semblent jouer un rôle important dans le maintien d’un système immunitaire sain.

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« Cette étude démontre vraiment davantage la relation entre notre microbiome intestinal et le système immunitaire », déclare Alan Embry, PhD, le chef de la branche des maladies respiratoires dans la division de la microbiologie et des maladies infectieuses à l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses. Le NIAID fait partie des National Institutes of Health (NIH), qui ont financé cette recherche.

Un regard plus attentif sur la façon dont les antibiotiques influencent la réponse immunitaire

« Cette recherche montre que la perturbation du microbiome chez certains individus a eu un effet mesurable sur les réponses vaccinales », explique le Dr. Embry, « mais beaucoup plus de travail est nécessaire pour comprendre si et comment l’utilisation normale des antibiotiques affectera la réponse au vaccin contre la grippe. »

L’équipe de recherche, dirigée par Bali Pulendran, PhD, professeur de pathologie et de microbiologie et immunologie à la faculté de médecine de l’Université Stanford, a examiné 22 volontaires pendant la saison de la grippe 2014-15 et 11 participants pendant la saison de la grippe 2015-16. Ils étaient âgés de 18 à 45 ans.

La moitié des individus de chaque groupe a reçu un régime d’antibiotiques à large spectre de cinq jours avant de se faire vacciner contre la grippe. Le mélange d’antibiotiques était composé de néomycine, de vancomycine et de métronidazole.

La vancomycine et le métronidazole sont couramment prescrits pour les infections gastro-intestinales telles que le Clostridium difficile (ou C. diff). La néomycine est un antibiotique utilisé non seulement pour réduire le risque d’infection lors d’une chirurgie intestinale, mais aussi pour traiter les infections cutanées.

L’inflammation augmente alors que les bactéries intestinales diminuent

Les chercheurs ont mesuré la réponse immunitaire au vaccin contre la grippe ainsi que la diversité et l’abondance des microbes intestinaux en analysant des échantillons de selles et de sérum sanguin prélevés à différents moments pendant une période de suivi d’un an.

Ils ont constaté que les personnes prenant les antibiotiques ont connu une baisse de 10 000 fois de leur population de bactéries intestinales – une perte qui a duré jusqu’à un an après la prise des médicaments. Ces participants ont également montré des signes d’inflammation systémique qui reflétaient un état pro-inflammatoire observé chez les personnes âgées de 65 ans et plus qui ont reçu le vaccin contre la grippe.

Les scientifiques supposent que l’inflammation pourrait être liée à la façon dont le microbiome régule l’acide biliaire.

Connexion entre la réponse au vaccin et l’immunité préexistante

La réponse au vaccin contre la grippe différait entre les deux groupes. Les 22 premiers volontaires de 2014-15 se sont avérés avoir des niveaux élevés d’anticorps contre la grippe au départ. Ainsi, qu’ils aient pris des antibiotiques ou non, ils avaient une immunité préexistante à la souche du virus de la grippe de cette saison.

Dans le groupe 2015-16, cependant, tous les participants sélectionnés avaient de faibles niveaux d’anticorps antigrippaux au départ et une faible immunité. Aucun n’avait reçu un vaccin contre la grippe au cours des trois années précédentes. Après avoir reçu le vaccin contre la grippe, ceux qui ont également pris les antibiotiques ont eu une baisse significative des anticorps qui les protégeraient du virus H1N1.

Les auteurs de l’étude suggèrent que si ces personnes étaient exposées à ce virus H1N1 après la vaccination, elles seraient très probablement moins protégées contre la grippe que les personnes n’ayant pas reçu d’antibiotiques.

« Il est intéressant de noter que l’effet sur la réponse au vaccin n’a été observé que chez les personnes ayant un faible niveau d’immunité préexistant à ce vaccin », explique Embry. « Il est important de noter que le traitement antibiotique n’a pas semblé avoir un impact significatif sur les réponses immunitaires chez ceux qui avaient des niveaux plus élevés d’immunité préexistante à la grippe. »

Le NIH s’engage à poursuivre la recherche sur le vaccin contre la grippe

William Schaffner, MD, spécialiste des maladies infectieuses et professeur de médecine préventive et de politique de santé à la faculté de médecine de l’université Vanderbilt à Nashville, Tennessee, considère que les résultats de l’étude s’appuient sur des preuves indiquant que le microbiome – les trillions de microbes qui vivent dans le tractus gastro-intestinal – a un effet omniprésent sur notre santé.

« La prise d’antibiotiques a clairement eu une réduction mesurable de la réponse immunitaire, mais nous ne savons pas encore si c’est cliniquement significatif », déclare le Dr Schaffner, qui n’a pas participé à l’étude. « Il se pourrait que si vous prenez des antibiotiques, ce ne soit pas le bon moment pour vous faire vacciner contre la grippe, mais nous ne sommes pas encore tout à fait au point en termes de recherche. »

Il souligne également que la combinaison d’antibiotiques utilisée dans cette enquête n’était pas une combinaison vue dans la pratique courante.

« Ce cocktail d’antibiotiques est un mélange très inhabituel d’ingrédients », dit Schaffner. « Il semble spécifiquement conçu pour tuer autant de bactéries intestinales que possible. »

Pour les recherches futures, Schaffner aimerait voir une population d’étude plus importante et une combinaison d’antibiotiques utilisée dans le traitement standard.

« Des travaux significativement plus importants doivent être réalisés pour vraiment comprendre l’impact réel du microbiome sur la grippe », déclare Embry.

Embry ajoute que le NIH continuera à soutenir la recherche explorant les facteurs qui peuvent améliorer la réponse immunitaire humaine aux vaccins contre la grippe.

La vaccination est recommandée, indépendamment de l’utilisation d’antibiotiques

« Cette étude est de nature précoce », dit Embry. « Pour l’instant, je ne suis pas sûr qu’il y ait quelque chose qui permette de dire définitivement qu’il faut attendre pour se faire vacciner contre la grippe si l’on a suivi un traitement antibiotique. À ce stade, je dirais qu’il est important de se faire vacciner contre la grippe lorsqu’il est recommandé de l’administrer pour la saison à venir. »

Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) recommandent toujours que toute personne âgée de six mois et plus se fasse vacciner contre la grippe chaque année. Le vaccin contre la grippe réduit le risque de maladie grippale de 40 à 60 % dans l’ensemble de la population pendant les saisons où la plupart des virus de la grippe en circulation sont bien adaptés au vaccin contre la grippe, selon les CDC.

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