Marion Sinclair est morte en 1988, la chanson est donc toujours sous copyright, selon la loi australienne sur le copyright. Les droits d’édition sont détenus par Larrikin Music. Aux États-Unis, les droits sont administrés par Music Sales Corporation à New York.
En juin 2009, Larrikin Music a poursuivi le groupe Men at Work pour violation du droit d’auteur, alléguant qu’une partie du riff de flûte du single « Down Under » du groupe en 1981 était copiée de « Kookaburra ». Cette action faisait suite à un épisode de Spicks and Specks où cette utilisation était la base d’une question du panel. Les avocats de la maison de disques et de la société d’édition du groupe (Sony BMG Music Entertainment et EMI Songs Australia) ont affirmé que, sur la base de l’accord en vertu duquel la chanson a été écrite, le droit d’auteur était en fait détenu par l’Association des guides. Le 30 juillet 2009, le juge Peter Jacobson de la Cour fédérale d’Australie a rendu une décision préliminaire selon laquelle Larrikin était bien titulaire des droits d’auteur sur la chanson, mais la question de savoir si les auteurs-compositeurs Colin Hay et Ron Strykert avaient plagié le riff serait déterminée ultérieurement. Le 4 février 2010, le juge Jacobson a rendu son jugement selon lequel Men at Work avait violé le droit d’auteur de Larrikin, et que les deux enregistrements soumis au tribunal « … reproduisent une partie substantielle de Kookaburra ». Larrikin a ensuite demandé au tribunal de recevoir entre 40 et 60 pour cent des redevances de la chanson antidatées à 1981, mais le 6 juillet 2010, le juge Jacobson a accordé à la société 5 pour cent des redevances antidatées à 2002 – ce qui serait une somme à six chiffres.
Le 31 mars 2011, un appel de la maison de disques EMI a été rejeté par les juges Arthur Emmett, Jayne Jagot et John Nicholas, qui ont conclu à une violation du droit d’auteur de l’air « Kookaburra Sits in the Old Gum Tree ». L’un des auteurs-compositeurs du groupe, Colin Hay, a déclaré après coup que le résultat était décevant et qu’ils allaient réfléchir à leur position après avoir examiné le jugement de plus près. En octobre 2011, le groupe a perdu sa dernière tentative judiciaire lorsque la Haute Cour d’Australie a refusé d’entendre un appel.