L’ajvar fait maison est fabriqué à partir de poivrons grillés, hachés puis cuits, alors que certains producteurs industriels utilisent des poivrons frais hachés, cuits ensuite avec de l’huile de tournesol, ce qui conduit à une qualité moindre. La préparation de l’ajvar est quelque peu difficile, car elle nécessite un travail manuel considérable, notamment pour éplucher les poivrons grillés. Traditionnellement, les gens le préparent au milieu de l’automne, lorsque les poivrons sont les plus abondants, et le conservent dans des bocaux en verre pour le consommer tout au long de l’année. Anecdotiquement, les stocks de la plupart des ménages ne durent pas jusqu’au printemps, lorsque les légumes frais deviennent disponibles, de sorte qu’il est généralement apprécié comme un aliment d’hiver. Souvent, toute la famille ou les voisins se réunissent pour préparer les poivrons. Le principal cultivar de poivron utilisé est appelé roga (c’est-à-dire « cornu »). Le Roga est gros, rouge, en forme de corne, avec une chair épaisse et relativement facile à peler. Il mûrit généralement à la fin septembre.
Pour produire l’ajvar, les poivrons sont rôtis entiers sur une plaque sur un feu ouvert, une plaque de bois dans un poêle, ou dans un four. Les poivrons cuits doivent refroidir brièvement pour permettre à la chair de se séparer de la peau. Ensuite, la peau est soigneusement pelée et les graines sont retirées. Les poivrons sont ensuite broyés dans un moulin ou coupés en petits morceaux (cette variante est souvent appelée pindjur). Enfin, la bouillie obtenue est mise à cuire à l’étouffée pendant plusieurs heures dans de grandes marmites. L’huile de tournesol est ajoutée à ce stade pour condenser et réduire l’eau, et pour améliorer la conservation ultérieure. Le sel (et parfois le vinaigre) est ajouté à la fin et la bouillie chaude est versée directement dans des bocaux en verre stérilisés, qui sont immédiatement fermés.