Arabiemiraatteja johtavat liittovaltion hallitus ja seitsemän emiirikunnan paikallishallinnot. Niiden valtuudet ja tehtävät on määritelty perustuslaissa.
Yhdysvaltain arabiemiirikuntien hallitusjärjestelmässä liittovaltion presidentin valitsee korkeimmaksi hallintoneuvostoksi kutsuttu elin. Korkein neuvosto on Yhdistyneiden arabiemiirikuntien ylin poliittinen elin, ja presidentti ja varapresidentti valitaan sen jäsenistä uusittavaksi viisivuotiskaudeksi.
Ylimmällä neuvostolla on sekä lainsäädäntö- että toimeenpanovalta. Sen lisäksi, että korkein neuvosto suunnittelee ja ratifioi liittovaltion lakeja, se hyväksyy presidentin nimittämän pääministerin ja sillä on valmiudet hyväksyä hänen eronsa tarvittaessa.
Pääministerin nimittää presidentti. Tämän jälkeen hän nimittää ministerineuvoston eli kabinetin, jonka tehtävänä on valvoa liittovaltion politiikkojen kehittämistä ja täytäntöönpanoa kaikissa hallituksen salkuissa.
Ylimmän neuvoston ja ministerineuvoston lisäksi 40-jäseninen parlamentti, joka tunnetaan nimellä liittovaltion kansallisneuvosto (Federal National Council, FNC), tutkii ehdotettuja uusia lakeja ja antaa tarvittaessa neuvoja Arabiemiirikuntien kabinetille. FNC:llä on valtuudet kutsua ministereitä koolle ja kuulustella heitä heidän omasta suorituksestaan, mikä lisää järjestelmän vastuullisuutta. Joulukuussa 2006 tehtiin uraauurtavia muutoksia päätöksenteon avaamiseksi, kun FNC:n jäsenet valittiin ensimmäistä kertaa epäsuorilla vaaleilla. Aiemmin kunkin emiraatin hallitsijat nimittivät kaikki FNC:n jäsenet.
Yhdistyneiden arabiemiirikuntien hallitusportaalissa on lisätietoja.