Terrorin paheksuminen
Dantonin maltillinen kanta korostui syksyllä 1793. Hän ei kuitenkaan puuttunut asiaan henkilökohtaisesti, vaan jätti ystäviensä tehtäväksi arvostella hallituksen politiikkaa. Hänen paheksuntansa terroristien sortotoimia kohtaan oli käynyt niin voimakkaaksi, että hän vetäytyi poliittisesta elämästä vetoamalla terveydellisiin tai perhesyihin. Girondineista hänen kerrotaan sanoneen ystävälleen lokakuun alussa 1793: ”En pysty pelastamaan heitä”, ja purskahtaneen kyyneliin. Lokakuun 12. päivänä hän sai valmistelukunnalta virkavapauden ja lähti kotikaupunkiinsa. Hän palasi 21. marraskuuta, joskin hänen paluunsa syyt jäävät epäselviksi.
Danton aloitti heti uudelleen poliittisen toiminnan. Hän tuki voimakkaasti yleisen turvallisuuden komiteaa kristinuskon vastaisen liikkeen ylilyöntejä vastaan ja vastusti myöhemmin perustuslaillisten pappien palkkojen lakkauttamista ja siten kirkon ja valtion erottamista. Dantonin tuki hallituksen vakauttamispolitiikalle ei epäilemättä ollut vailla taka-ajatuksia, sekä henkilökohtaisia että poliittisia; hän oli päättänyt pelastaa ystävänsä, jotka oli pidätetty tai jotka olivat pidätyksen vaarassa. Mutta hän halusi myös hidastaa hallituksen vallankumouspyrkimyksiä. Dantonin politiikka vastusti kaikilta osin Jacques Hébertin ja hänen Cordeliers-ystäviensä kannattamaa kansankiihkoilun ohjelmaa: äärimmäinen terrori, sota loppuun asti.
Danton määritteli maltillisen poliittisen linjansa 1. joulukuuta 1793 ilmoittaessaan vallankumouksellisille radikaaleille, että heidän roolinsa oli päättynyt. Siitä lähtien häntä pidettiin maltillisen opposition johtajana, olipa se ollut hänen tarkoituksensa tai ei. Vuoden 1794 alussa Danton ja hänen ystävänsä ottivat vielä kriittisemmän asenteen, ja vallankumouksellinen toimittaja Camille Desmoulins, Le Vieux Cordelier -lehden toimittaja, toimi heidän tiedottajanaan. He kyseenalaistivat paitsi Robespierren terrorijärjestelmän myös koko vallankumoushallituksen politiikan ja herättivät samalla toiveita hallinnon vastustajissa.
Kun hallitus kuitenkin tajusi, ettei se voinut antaa oikealta tulevan ylivoiman vallata itseään, tilanne kääntyi jyrkästi. Kun Fabre d’Églantine, draamakirjailija ja innokas vallankumouksellinen, Compagnie des Indesin tapauksessa kompromissin tehnyt Fabre d’Églantine pidätettiin tammikuussa 1794, Danton yritti puolustaa häntä epäsuorasti vaatimalla, että pidätetyt kansanedustajat olisi tuomittava kansan edessä. ”Voi sitä, joka istui Fabren rinnalla ja on yhä hänen hölmöläisensä!”, huusi eräs kansanedustaja uhaten selvästi Dantonia itseään.
Välikohtaus merkitsi muutakin kuin indulgenttien hyökkäyksen tappiota, sillä jo valmiiksi kompromissin tehneinä heitä itseään uhkasi pian heidän vastustajiensa, Hébertin ultravasemmistolaisen ryhmittymän, Exagérésin eli Enragésin, vastahyökkäys. Kun kriisi kuitenkin kärjistyi ja Exagéré-oppositio tiukensi asemaansa, hallitus menetti kärsivällisyytensä: maaliskuussa 1794 Hébert ja tärkeimmät Cordeliers-johtajat pidätettiin. Heidät tuomittiin kuolemaan ja teloitettiin 24. maaliskuuta. Indulgentit uskoivat, että heidän hetkensä oli koittanut, ja lisäsivät painostustaan. Hallituksella ei kuitenkaan ollut aikomustakaan antaa oikeiston maltillisen opposition nujertaa itseään. Dantonia varoitettiin useita kertoja häntä uhkaavista uhkista, mutta hän ei pelännyt: ”He eivät uskalla!” Lopulta hänet ja hänen ystävänsä pidätettiin 29.-30. maaliskuuta 1794 välisenä yönä.