Hausgemachtes Ajvar wird aus gerösteten, gehackten und dann gekochten Paprikaschoten hergestellt, während einige industrielle Hersteller frische gehackte Paprikaschoten verwenden, die anschließend in Sonnenblumenöl gekocht werden, was zu einer geringeren Qualität führt. Die Zubereitung von Ajvar ist etwas schwierig, da sie viel Handarbeit erfordert, vor allem beim Schälen der gerösteten Paprika. Traditionell wird Ajvar in der Mitte des Herbstes zubereitet, wenn die Paprikaschoten am reichlichsten vorhanden sind, und in Gläsern für den Verzehr während des ganzen Jahres aufbewahrt. Erfahrungsgemäß reichen die Vorräte in den meisten Haushalten nicht bis zum Frühjahr, wenn wieder frisches Gemüse verfügbar ist, so dass er in der Regel als Wintergericht genossen wird. Oft kommen die ganze Familie oder die Nachbarn zusammen, um die Paprika zuzubereiten. Die wichtigste Paprikasorte, die verwendet wird, heißt Roga (d. h. „gehörnt“). Roga ist groß, rot, hornförmig, hat ein dickes Fruchtfleisch und lässt sich relativ leicht schälen. Er reift in der Regel Ende September.
Zur Herstellung von Ajvar werden Paprikaschoten im Ganzen auf einer Platte auf offenem Feuer, einer Holzplatte im Ofen oder im Ofen geröstet. Die gebackenen Paprikaschoten müssen kurz abkühlen, damit sich das Fruchtfleisch von der Haut lösen kann. Dann wird die Haut vorsichtig abgezogen und die Kerne werden entfernt. Die Paprikaschoten werden dann in einer Mühle gemahlen oder in kleine Stücke gehackt (diese Variante wird oft als Pindjur bezeichnet). Schließlich wird das entstandene Mus mehrere Stunden lang in großen Töpfen gedünstet. In dieser Phase wird Sonnenblumenöl hinzugefügt, um das Wasser zu kondensieren und zu reduzieren und die spätere Konservierung zu verbessern. Zum Schluss wird Salz (und manchmal auch Essig) hinzugefügt, und das heiße Mus wird direkt in sterilisierte Gläser gefüllt, die sofort verschlossen werden.